• Tuesday May 21,2019

Kategoria - ludzka genetyka


Race: może to jest rolnictwo

Race: może to jest rolnictwo

Jestem zbyt zajęty, aby naprawdę blogować dzisiaj, ale pomyślałem o umieszczeniu postu, którego treść została faktycznie wyrażona w komentarzu Iana poniżej: Kiedy byłem młodszy, myślałem o rasach ludzkich jako archetypach, a różnica między nimi była produktem mieszania. Obwiniam to, że czytałem Coona, gdy miałem około 14 lat. Mimo to, jako (na wpó

Większość linii mtDNA rozwinęła się przed neolitem?

Większość linii mtDNA rozwinęła się przed neolitem?

Nowa krótka komunikacja w Scientific Reports sugeruje, że większość ekspansji demograficznej, jaką stwierdzono przy użyciu mtDNA, wystąpiła przed neolitem. Analiza MtDNA populacji globalnych potwierdza, że ​​główne ekspansje populacji rozpoczęły się przed czasem neolitu: Rolnictwo spowodowało znaczne przyrosty populacji i działalność człowieka. Jednak to, czy główne

Rekonstrukcja genetycznych zmarszczek w czasie i przestrzeni

Rekonstrukcja genetycznych zmarszczek w czasie i przestrzeni

Niezrównany Joe Pickrell zrzucił swój przedpolem Khoisan-are-part-Italian na arXiv, staroazjatyckich przodków Eurazji w południowej i wschodniej Afryce. W swojej charakterystyce zasadniczego wniosku papieru jestem głupkiem, ale jest powód dla takiej reakcji zwrotnej: wnioski, które wydaje się wyciągnąć z danych genetycznych, wydają mi się szalone . Ale to jest

Merina z Madagaskaru to Malay i Bantu

Merina z Madagaskaru to Malay i Bantu

Miesiąc temu poprosiłem o genotyp Madagaskaru. Niemal natychmiast otrzymałem odpowiedź od kogoś, kto był 33% Malgaszem. Niedawno wysłałem zestaw genotypów do kogoś, kto jest Malgaszem. Te wyniki powinny pojawić się w ciągu miesiąca. Ale kilka dni temu otrzymałem kontakt od osoby z etnicznej grupy Meriny góralskiego Madagaskaru. Więc oczywiści

Prezentacje genetyczne człowieka interesujące

Prezentacje genetyczne człowieka interesujące

Dienekes ostrzega mnie, że streszczenia International Congress of Human Genetics są dostępne online. Spędziłem godzinę, używając tylko kilku słów kluczowych, i wymyśliłem wiele. 1) Jeśli masz prezentację i myślisz, że może zainteresować czytelników tutaj, nie krępuj się wrzucić link (będę szukać w folderze spam więcej dzisiaj, chociaż jeden link nie powinien doprowadzać go do szaleństwa). 2) Jeśli jesteś czytelnikie

Używanie danych 23andMe: jak jesteś wsobny?

Używanie danych 23andMe: jak jesteś wsobny?

Wcześniejsze wydania: Używanie danych 23andMe: eksploracja za pomocą MDS Używanie danych 23andMe w Plink Od rekonstrukcji historii ludności indyjskiej: . Postawiliśmy hipotezę, że efekty założycielskie są odpowiedzialne za jeszcze większe obciążenie chorobami recesywnymi w Indiach niż w przypadku pokrewieństwa . Aby przetestow

Przywileje i obciążenia związane z nowatorską inwersją

Przywileje i obciążenia związane z nowatorską inwersją

Są dwa artykuły w Nature Genetics na 17q21.31 oraz zmienność haplotypów inwersji w populacjach całego świata. Oto część dyskusji z pierwszego artykułu: Podsumowując, proponujemy, aby odwieczny haplotyp H2 pojawił się we wschodniej lub środkowej Afryce i rozprzestrzenił się na południe Afryki przed pojawieniem się anatomicznie współczesnych ludzi. Około 2, 3 miliona

Amerykański wyjątek Anglosphere (?)

Amerykański wyjątek Anglosphere (?)

PLoS ONE ma inny artykuł o domieszkowaniu w Argentynie. Interesującym aspektem jest to, że Argentyna, podobnie jak Stany Zjednoczone czy Australia, jest krajem pochodzenia europejskiego , a zatem w przeciwieństwie do Meksyku, Bolivy czy Brazylii, z których każdy de iure lub de facto popiera wielokulturowość i wielorasowość. tożsamoś

Zgoda i genomika

Zgoda i genomika

Interesująca historia w The New York Times , Genes Now Tell Doctors Secrets Nie mogą: Jeden z pierwszych przypadków przyszedł dekadę temu, tak jak zaczęła się nowa epoka genetyki. Młoda kobieta z silną historią raka piersi i jajnika w rodzinie wzięła udział w badaniu próbującym znaleźć geny nowotworowe, które po zmutowaniu znacznie zwiększają ryzyko raka piersi. Ale kobieta, przera

 "Missing heritability " - edycja interakcji

"Missing heritability " - edycja interakcji

The Pith: Wiele ważnych medycznych różnic genetycznych między ludźmi może wynikać z natury interakcji wariantów genetycznych. Jeśli czytasz tego bloga od jakiegoś czasu, wiesz, że jest teraz pytanie o genomikę co do "braku odziedziczalności". Problem polega zasadniczo na tym, że istnieją cechy, w których wzorce dziedziczenia w obrębie populacji silnie sugerują, że większość zmienność wynika z genów, ale próby ustalenia, które specyficzne warianty genetyczne są odpowiedzialne za tę odmianę, nie przyniosły wiele. Na przykład, z wysokością mas

Nikt nie odważy się nazwać tego eugeniką!

Nikt nie odważy się nazwać tego eugeniką!

Cóż, prawie nikt: "Niewypowiedziany główny powód społecznego tabu i zakazu na kazirodztwo to możliwość dziedzicznych wad - czynnik, o którym wspominał jedynie Strasburg. Ale intencja kryjąca się za argumentem eugenicznym to taki, który jest nie do obrony, i to nie tylko w Niemczech ze straszliwą nazistowską przeszłością: zwiększone ryzyko dziedzicznych defektów nie usprawiedliwia zakazu prawnego. W przeciwnym razie

Genetyczna odrębność a różnorodność genetyczna

Genetyczna odrębność a różnorodność genetyczna

Spotkanie z Taino W komentarzach poniżej kilka dni temu ktoś wyraził zaniepokojenie zmniejszeniem różnorodności genetycznej z powodu zniknięcia rdzennej ludności. Moja odpowiedź była zasadniczo taka , że to zależy. Chodzi o to, czy to zniknięcie wynika z asymilacji, czy wymarcia. Jeżeli dana populacja jest genetycznie zaabsorbowana przez inną, oczywiście ich różnorodność genetyczna jest w zasadzie utrzymywana. Znikają specyficzn

GIF genomiki

GIF genomiki

Jak zapewne wiesz, niekończący się patent na patogeny genetyczne Myriad robi fale w sądach, ostatnio z mieszanym rezultatem, czy ich patenty na kilka specyficznych diagnostyki genetycznych są ważne. Ten aspekt wymaga podkreślenia: Jeden z trzech decydujących sędziów, William Bryson, nie zgadza się z opinią większości, argumentując, że twierdzenia Myriad dotyczące genu BRCA i fragmentów genów nie są ważne. Pisze on, że obawia

Geny w kosmosie

Geny w kosmosie

Od tych samych ludzi, którzy przynieśli wam genetyczną mapę Europy, bardzo ważny artykuł, Modelowe podejście do analizy struktury przestrzennej w danych genetycznych. Oto streszczenie: Charakteryzowanie różnorodności genetycznej w populacjach i między nimi ma szerokie zastosowanie w badaniach chorób i ewolucji człowieka. Proponujemy

Szerokości i długości oraz sferyczne krowy

Szerokości i długości oraz sferyczne krowy

Nowy artykuł w American Journal of Physical Anthropology bada zmienność genów na szerokościach i długościach geograficznych. Autorzy stwierdzili, że zarówno szerokość i długość geograficzna były znaczące w obu Amerykach, podczas gdy szerokość geograficzna była znaczna w Eurazji. Użyli mikrosatelitów, co jest w porządku. Główną kwestią, któr

Europa na północny wschód

Europa na północny wschód

Projekt Fennoscandia przeszedł teraz przez chromosomy od 1 do 6 z Chromopainter / fineSTRUCTURE. Konkluzja: Jeśli patrzymy na większy obraz, widzimy, że większość kontynentalnej Europy jest ze sobą powiązana bardziej niż inne, co utrudnia ich oddzielenie nawet na tym poziomie (6 chromosomów). Widzimy,

Genom mongolski?

Genom mongolski?

Cóż, niezupełnie. Musisz przeczytać artykuł "Genomiczna analiza doboru naturalnego i odmian fenotypowych u Mongołów na dużych wysokościach", aby zobaczyć, dlaczego jestem sceptyczny. Szczerze mówiąc, nie wydaje się, że znaleźli zbyt dużo uwagi w swoich wynikach, więc jestem trochę zmieszany, dlaczego ten artykuł dostał się do PLOS GENETICS (i żeby dać należny kredyt, ta grupa opublikowała bardzo interesującą pracę w przeszłości na którą się uśmiechnąłem). Dlaczego więc piszę o tym artykule

Sygnał domieszki indo-aryjskiej w południowoindyjskich braminach

Sygnał domieszki indo-aryjskiej w południowoindyjskich braminach

Wspomniałem już kilka razy, że laboratorium Rzeszy znajdowało sugestywne dowody na domieszkę między rdzennymi południowo-azjatyckimi a zachodnioeazjatyckimi grupami, rzędu ~ 3000 lat przed teraźniejszością. Modalne wyjaśnienie jest prawdopodobnie intrygą indyjsko-aryjską. Dienekes wykorzystał roll-off w ADMIXTOOLS, aby powtórzyć te ogólne ustalenia. W szczególności

Geny to prawdopodobieństwo, a nie przeznaczenie

Geny to prawdopodobieństwo, a nie przeznaczenie

W moim przekazie na Facebooku niektórzy z moich genetyków opowiadali o artykule w " The New York Times" , "Badanie mówi, że moc DNA do przewidywania choroby jest ograniczona". Artykuł opiera się na artykule Predictive Capacity of Personal Genome Sequencing. Z kolei ten artykuł, jak również zapis w The New York Times , został szeroko skrytykowany w społeczności genomicznej i genetycznej. Z drugiej

Dlaczego melanezyjczycy są rozwiązani na blond?

Dlaczego melanezyjczycy są rozwiązani na blond?

Sortuj i możliwe. Mówiłem o tym od lat, a Greg Cochran wskazuje mi streszczenie na konferencji human genetics, o której mowa wcześniej. Nowa odmiana kodująca w TYRP1 wyjaśnia dużą część zmienności w kolorze włosów Solomon Islanders: Archipelag Wysp Salomona składa się z ponad 1000 wysp położonych na wschód od Papui Nowej Gwinei i ma populację o dużej zmienności w pigmentacji włosów. Pobrano 1200 próbek z 1